כמה מדויק רצף סנגר?

2024 מְחַבֵּר: Stanley Ellington | [email protected]. שונה לאחרונה: 2023-12-16 00:17

רצף סנגר עם 99.99% דיוק הוא "תקן הזהב" למחקר קליני רצף . עם זאת, טכנולוגיות חדשות יותר של NGS הופכות נפוצות גם במעבדות מחקר קליניות בשל יכולות התפוקה הגבוהות שלהן ועלויות נמוכות יותר למדגם.

נשאל גם, למה NGS יותר טוב מסאנגר?

סנגר רצף יכול לרצף רק קטע אחד בכל פעם. כי NGS משתמש בתאי זרימה שיכולים לקשור מיליוני חתיכות DNA, NGS יכול לקרוא את כל הרצפים הללו בו זמנית. תכונת תפוקה גבוהה זו הופכת אותו לחסכוני מאוד בעת ריצוף של כמות גדולה של DNA.

בנוסף, מה הטעם ברצף Sanger? רצף סנגר הוא תהליך של שילוב סלקטיבי של dideoxynucleotides מסיימים שרשרת על ידי DNA פולימראז במהלך שכפול DNA חוץ גופית; זוהי השיטה הנפוצה ביותר לזיהוי SNVs.

לאחר מכן, אפשר גם לשאול, מה ההבדל בין רצף סנגר לרצף הדור הבא?

הַבָּא - רצף דורות טכנולוגיות (NGS) דומות. הקריטיים ההבדל בין רצף Sanger ו-NGS הוא רצף כרך. בזמן ש סנגר שיטה בלבד רצפים קטע DNA בודד בכל פעם, NGS מקביל בצורה מאסיבית, רצף מיליוני שברים בו זמנית בכל ריצה.

כיצד פועל רצף סיום השרשרת?

Sanger DNA רצף ידוע גם בשם שַׁרשֶׁרֶת - סיום שיטה של רצף . ddNTPs מביאים סיום של גדיל ה- DNA מכיוון שחסרות ddNTP חסרות את קבוצת 3'-OH הנדרשת ליצירת קשר פוספודיאסטר בין נוקלאוטידים. ללא קשר זה, ה שַׁרשֶׁרֶת של נוקלאוטידים שנוצרים הוא הופסק.