כיצד פועל רצף ה-DNA של Sanger?

2024 מְחַבֵּר: Stanley Ellington | [email protected]. שונה לאחרונה: 2023-12-16 00:17

רצף סנגר גורם ליצירת מוצרי הרחבה באורכים שונים המסתיימים עם dideoxynucleotides בקצה 3 '. מוצרי ההרחבה מופרדים אז על ידי נימי אלקטרופורזה או CE. המולקולות מוזרקות על ידי זרם חשמלי לתוך נימי זכוכית ארוכה מלאה בפולימר ג'ל.

בדרך זו, מהי שיטת סנגר לרצף DNA?

רצף סנגר , המכונה גם סיום השרשרת שיטה , היא טכניקה עבור רצף DNA מבוסס על שילוב סלקטיבי של dideoxynucleotides (ddNTP) המסתיים בשרשרת DNA פולימראז במבחנה DNA שכפול. זה פותח על ידי פרדריק סנגר ועמיתיו ב-1977.

כמו כן, כיצד פועל רצף סיום השרשרת? Sanger DNA רצף ידוע גם בשם שַׁרשֶׁרֶת - סיום שיטה של רצף . ddNTPs מביאים סיום של גדיל ה- DNA מכיוון שחסרות ddNTP חסרות את קבוצת 3'-OH הנדרשת ליצירת קשר פוספודיאסטר בין נוקלאוטידים. ללא קשר זה, ה שַׁרשֶׁרֶת של נוקלאוטידים שנוצרים הוא הופסק.

פשוט כך, למה אנחנו עושים רצף Sanger?

רצף סנגר הוא א שיטה שֶׁל רצף DNA מבוסס על שילוב סלקטיבי של dideoxynucleotides המסתיים בשרשרת על ידי DNA פולימראז במבחנה DNA שכפול. עדיין יש לו יתרון על פני קריאה קצרה רצף טכנולוגיות (כמו אילומינה) שזה פחית ליצר רצף DNA קריאות של מעל 500 נוקלאוטידים.

האם רצף סנגר מדויק?

רצף סנגר עם 99.99% דיוק הוא "תקן הזהב" למחקר קליני רצף . עם זאת, טכנולוגיות חדשות יותר של NGS הופכות נפוצות גם במעבדות מחקר קליניות בשל יכולות התפוקה הגבוהות שלהן ועלויות נמוכות יותר למדגם.