למה NGS טוב יותר מסאנגר?

2024 מְחַבֵּר: Stanley Ellington | [email protected]. שונה לאחרונה: 2023-12-16 00:17

גודל המדגם

NGS הוא זול משמעותית, מהיר יותר, צריך הרבה פחות DNA והוא יותר מדויק ואמין מאשר סנגר רצף. הבה נסתכל על זה יותר מקרוב. ל סנגר רצף, יש צורך בכמות גדולה של templateDNA עבור כל קריאה

אנשים גם שואלים, מהם היתרונות של רצף הדור הבא?

לכל אחד יש ספציפי יתרונות לקריטריונים: אורך קריאה, דיוק, זמן ריצה ותפוקה. בנוסף לניתוח של רצפי DNA, התקדמות של רצף הטכנולוגיות הביאו לניתוח של רכיבים ביולוגיים אחרים כמו RNA וחלבון, כמו גם איך הם מקיימים אינטראקציה ברשתות סלולריות מורכבות.

אפשר גם לשאול, מדוע עדיין משתמשים ברצף Sanger? רצף סנגר השתפר עם השנים, חלק גדול יותר עקב אוטומציה, והיה הבסיס ל רצף הגנום האנושי הראשון בשנת 2000. עם זאת, תוך פחות משני עשורים, NGS עקף רצף סנגר בשל התפוקה הגבוהה, הפעולה המקבילה והעלות הנמוכה בהרבה.

בהתאם, מה ההבדל בין רצף Sanger לרצף הדור הבא?

כל נוקלאוטיד משולב מזוהה על ידי תג הפלואורסצנטי שלו. הקריטיים ההבדל בין רצף Sangers ו-NGS הוא רצף כרך. בזמן ש סנגר שיטה בלבד רצפים קטע DNA בודד בכל פעם, NGS מקביל בצורה מאסיבית, רצף מיליוני פרגמנטים בו זמנית בכל ריצה.

כמה מדויק רצף סנגר?

רצף סנגר עם 99.99% דיוק הוא "תקן הזהב" למחקר קליני רצף . עם זאת, טכנולוגיות NGS חדשות יותר הופכות נפוצות גם במעבדות מחקר קליני בשל יכולות התפוקה הגבוהות שלהן והעלויות הנמוכות יותר למדגם.